VIDR

背景

控制传染病仍然是人类和兽医医学的一个关键优先事项。世界卫生组织(世卫组织)估计，呼吸道和腹泻感染、艾滋病毒、结核病、疟疾和麻疹造成了90%的人类死亡，在需求快速增长之际，大量动物病原体威胁着粮食安全。

许多不同的物种，从非脊椎动物到啮齿动物和非人灵长类动物，都被用于研究感染、宿主反应以及药物和疫苗的功效。通常情况下，动物被感染一种感染因子来测试治疗效果，导致不同严重程度的症状。一个可靠的在网上感染模型和宿主反应将导致减少动物的使用。理想情况下，这样的模型将为未来的模型提供基础，这些模型将有助于预测药物、疫苗和其他治疗的效果。

生物科学的一个重点是利用大型数据集的可用性来开发计算工具，以产生从单个实验中不明显的结果。传染病的"虚拟"数据包括与以下方面有关的各种信息:

1. 病原和宿主基因的序列、转录、翻译、调控和功能。
2. 宿主免疫反应。
3. 通过基因修饰、药物或疫苗调节病原体和宿主功能对感染结局的影响。
4. 病原体与宿主细胞或其产物的时空迁移、相互作用和活性。

挑战在于如何使用这些数据来开发可测试的预测，特别是当这些数据通常反映一个组织在特定时间间隔内的平均值，因此可能不能在更精细的空间和时间水平上完全反映事件时。新利体育网页版

虽然目前正在使用复杂的数学模型来模拟感染在整个人类群体中的传播和免疫反应，但不太常用模型来研究感染和反应在宿主内部的动态。这个挑战的重点是使用在网上在单个动物中模拟感染和宿主反应的方法。目标是雇佣在网上方法:

1. 减少动物的使用。
2. 模型在活的有机体内发病机理和保护。
3. 模拟药物或疫苗在加速开发传染病治疗方法方面的潜在影响。

3 rs的好处

在新抗生素或疫苗的典型啮齿动物功效研究中，每个候选动物可能涉及约100只动物。动物在接种疫苗或用相关药物治疗后感染了病原体。通常使用未经处理的对照。在对照动物和疫苗或药物无效的动物中，由此产生的疾病会造成严重的痛苦。的使用在网上研究疾病生物学和预测疗效的方法将减少使用的动物数量。

第一阶段的赢家

项目团队由:

• 汤姆·弗里曼教授，爱丁堡大学，84561英镑。
• 约克大学教授保罗·凯伊，10万英镑。

第二阶段的赢家

项目团队负责人:

• Paul Kaye教授，约克大学,£996464。

充满挑战的信息

利什曼病是一种由利什曼原虫引起的疾病，由沙蝇在热带和亚热带国家传播。全世界每年约有1200万慢性病例，约有200万新的临床病例。每年大约有4万人死于最严重的内脏利什曼病。目前只有少数几种药物可以治疗利什曼病，其中大多数会产生严重的副作用，耐药性是一个日益严重的问题。目前尚无可用于人体的疫苗。

为了应对VIDR挑战，并作为改善利什曼病患者治疗的全球努力的一部分，该团队开发了一个包含计算模型和实验数据的虚拟实验室，以发现如何更有效地使用现有药物，确定新的药物靶点，并开发或重新利用生物疗法。

的LeishSim虚拟实验室是一个在网上探讨慢性内脏利什曼原虫感染宿主的计算模型的平台。虽然目前正在使用复杂的数学模型来模拟感染在整个人类群体中的传播和免疫反应，但不太常用模型来研究宿主内部感染和反应的动力学。

该平台模拟感染和宿主在单个动物中的反应:

• 减少用于开发治疗方法的动物数量。
• 模型在活的有机体内发病机理和保护。
• 模拟药物或疫苗在加速开发传染病治疗方法方面的潜在影响。

LeishSim虚拟实验室为这种方法提供了一个用于其他疾病的框架，该团队目前正在开发其应用程序，用于结节病的药物开发。