降低和替换非洲锥虫病中功能遗传学的动物成本

人类非洲锥虫病（帽子），美国锥虫病和利什曼病的每年影响> 2000万人。相关的寄生虫会引起非洲动物锥虫病（AAT），每年约有7000万例牲畜疾病，给非洲，亚洲和南美的农村社区带来了巨大的经济负担。许多实验室在HAT和AAT模型中使用功能遗传学来识别对感染建立，宿主生存，传播和耐药性重要的基因。但是，疾病模型中锥虫基因功能的测试通常涉及低统计能力的基因方法，使用实验室适应的菌株，这些菌株不代表野外分离株的行为，并且需要大量的实验动物。通过取代并行化的传统方法可以大大减少使用。

我们设计了一种用于高度平行的突变体表型，直接RNAi-Fragment测序（DRIF-SEQ）的方法，该方法与捕获人类疾病生物学的寄生虫菌株兼容。来自一组145个基因的初步数据表明，该方法可用于动物模型中，以产生强大的定量测量突变体适应性。通过在单个感染中遵循1000秒的单个突变体，体内Drif-Seq还捕获了克隆变异，并且在传统方法不是的感染中对感染的重要点很敏感，但所需的动物比测试单个基因突变体所需的动物更少。该项目赠款将证明并验证体内Drif-Seq在HAT感染模型中测试基因集的适用性，以便可以广泛采用（还原）。我们还将在锥虫中扩展体内DRIF-SEQ至基因组量表，从而导致帽子和最重要的AAT物种 - 有效地消除了基本的效果估计中新的实验动物用法，构成了当前使用的很大比例（还原/减少/替换）。